最近、WordPress を 3.4.2 から 3.6 にアップデートしたところ、固定ページを更新するとテンプレートがデフォルトテンプレートになってしまう不具合が起きるサイトがありました。
例えば、トップページの編集画面を開いて更新ボタンをクリックすると、トップページ用のテンプレートがデフォルトテンプレートに勝手に切り替わってしまいます。
再度編集画面を開いてテンプレートを選び直しても、更新するとまたデフォルトテンプレートに戻ってしまいます。
いろいろと調べてみて、ようやく原因がわかりました。
サーバ上でテーマが置いてあるディレクトリに [以前のファイル] というディレクトリが作られていて、このディレクトリの中に以前の.phpファイル(テンプレートのファイル)がバックアップとして残されていたのが原因でした。
試しにこのディレクトリの名前を [old_files] に変更してみたところ、不具合が解消されました。
このディレクトリを残しておくといずれまた不具合の原因になるかもしれないので、バックアップはパソコンの方にだけ残すようにして、このバックアップ用のディレクトリをサーバから削除しておきました。